本病的内科治疗原则及用药和溃疡性结肠炎大致相同。
一、一般治疗 有活动期病变者宜卧床休息，给高热量、易消化、富营养饮食。严重病人应予补液，纠正脱水和电解质平衡失调，静脉高营养疗法或鼻饲要素饮食。
二、水杨酸偶氮磺胺吡啶 对本病有一定疗效，用法参照溃疡性结肠炎。
三、肾上腺糖皮质激素 适用于本病的活动期，对控制症状有效。
四、其他 为控制肠道继发感染要选用氨苄青霉素等，针对肠道厌氧菌感染可给甲硝唑。
五、手术治疗 故手术适应证限于肠穿孔、完全性肠梗阻、下消化道大出血、瘘管及脓肿形成，经内科治疗无效的中毒巨结肠及疑有结肠癌等。
本病经治疗后可好转或自行缓解。但多数病人迁延不愈，反复发作，预后不佳。
起病多数缓慢、病程呈慢性隐匿过程，有活动期和缓解期相交替的趋势。少数为急性起病，可表现为急腹症、肠穿孔、肠梗阻等。
一、腹痛 是最常见的症状，多位于右下腹或脐周，一般为中等度疼痛，呈痉挛性，餐后加重，禁食、休息、局部热敷可减轻。如炎症波及腹膜或急性肠穿孔时可出现全腹剧痛，呈急性腹膜炎表现。
二、腹泻 粪便呈糊状，一般每日3－4次，常无脓血及粘液，病变位于结肠远端常有粘液血便。
三、腹块 由于肠壁或肠系膜增厚、肠粘连、肠系膜淋巴结肿大，内瘘或局部脓肿形成，故常可于右下腹扪及包块，比较固定，边缘不很清楚，有压痛。
四、瘘管形成 为本病的特征性体征。
五、肛门直肠周围病变。
六、全身表现 约三分之一的病人有间歇性低热或中等度发热，偶有高热。严重者可有贫血、消瘦、低蛋白血症及水电解质紊乱。
七、肠外表现 部分病人有鹅口疮性口炎、结节性红斑、杵状指、皮肤溃疡、关节炎和肝肿大等。
病因迄今未明，目前认为本病，可能系多种因素的综合作用。可能与下列因素有关：
一、感染。
二、免疫反应：确切机制尚未明确。
三、遗传 家族中的发病率较高，占10－20％。
一、血液检查 常有贫血、白细胞增多、红细胞沉降率加速。
二、粪便检查 隐血试验常呈阳性。
三、胃肠X线钡餐检查 是诊断本病的重要方法。
四、纤维结肠镜检查 对全结肠及回肠未端病变有诊断价值。
一、未病前的预防
中医学认为本病是由于脾肾虚弱、感受外邪、情志内伤、饮食劳倦等因素导致的。现代医学认为克隆病的发病原因不明确，可能与病毒感染、免疫、遗传因素有密切关系。结合中西观点，可从生活起居、饮食、精神调养、增强体质等几个方面进行预防。
1.生活起居要有规律；
2.禁食生冷不洁食物；
3.精神调养；
4.适当进行体育锻炼；
二、已病后的预防（预后）
本病为一慢性反复发作的疾病。由于病因不明，尚无根本的治愈方法。许多病人在其病程中都会出现一次以上的并发症需要手术治疗，而手术治疗的复发率甚高，有报道可达90%。本病的复发率与病充数范围和病症侵袭的强弱等因素有关。所幸死亡率还不高。此外，本病随病程的延长和年龄的增长，复发率逐渐降低而健康者的比率升高。近年来采用各种治疗措施对多数病人是有效的，可帮助患者度过病情活动期的难关。